Открытие филиала — почти всегда шаг вперёд: новые рынки, дополнительные люди, более высокая выручка. Но вместе с возможностями приходит непростой выбор налогового режима. Компанию, которая долгие годы жила на упрощёнке, может внезапно настигнуть обязанность перейти на общую систему. Разберём, почему это происходит, как работать с НДС, что учитывать в 2025–2026 годах и как не потерять деньги из-за формальностей.
Филиал — не отдельное юрлицо, а обособленное подразделение головной организации. Он ведёт деятельность по доверенности, но имеет собственный учёт заработной платы, имущества и, главное, налогооблагаемой базы. Разрозненные участки учёта усложняют жизнь бухгалтерии: если раньше хватало пары регистров по УСН, то теперь придётся учитывать каждую копейку, чтобы доказать инспектору, что лимит упрощёнки не превышен.
Добавим сюда территориальный фактор. Филиал чаще всего регистрируют в другой инспекции: придётся подавать отчётность и туда, и по месту основной регистрации. Этот двойной контроль заставляет компанию держать документацию в образцовой чистоте, что фактически подталкивает к более строгой системе налогообложения.
С УСН бухгалтер часто ведёт учёт «кассовым» методом, но при появлении филиала нужно выделять обороты по каждому подразделению. Если головной офис остаётся на упрощёнке, а филиал переходит на общую систему, организация сталкивается с двумя разными наборами регистров: книга доходов-расходов для УСН и журналы-ордеры, оборотно-сальдовая ведомость, декларация по НДС для ОСНО.
На практике смешанный подход оборачивается дополнительными затратами: новый бухгалтер, консультации, программный софт. Опыт показывает, что когда расходы на администрирование приближаются к экономии на налогах, предприниматели предпочитают единый режим для всех подразделений.

Ключевой стоп-кран для упрощёнки — лимит выручки. Сейчас он составляет 200 млн рублей за календарный год. Заглядывая вперёд, эксперты ждут, что лимит НДС на УСН пересмотрят уже к 2025 году. Филиал способен быстро вытолкнуть компанию за эту планку. Для производственных компаний опасен ещё один показатель — стоимость основных средств: 150 млн рублей. Штат больше 130 человек тоже закрывает дорогу УСН, и филиалы, привлекающие десятки продавцов или инженеров, легко переваливают эту черту.
Кроме формальных критериев, есть косвенные. Например, участвуя в тендерах, филиал предъявляет контрагентам счёт-фактуру и часто слышит: «Мы работаем только с плательщиками НДС». Потенциальная потеря крупных заказов становится решающим фактором перехода.
Иногда руководство само инициирует перемены. В логистической компании автору статьи довелось наблюдать, как после запуска дальневосточного филиала директор попросил «не тянуть» до официального превышения лимитов. Причин было две: планируемая сделка с импортёром, для которой требовался вычет НДС, и нежелание поддерживать двойную методологию учёта. Добровольный переход в середине года оформляют уведомлением 26.2-3, поданным в инспекцию не позднее 15 дней с начала квартала.
Первое, что придётся сделать, — переобучить персонал. При УСН многие предприятия держат одногоexperienced бухгалтера, но НДС требует штат из трёх-четырёх специалистов: учёт первички, расчёт заработной платы, подготовка деклараций. Понадобится обновление 1С или переход на облачную ERP с модулем налогового учёта.
Проверьте настройку аналитики: для филиала понадобятся субконто «Подразделения» и «Проекты», чтобы автоматически формировать книгу продаж и книгу покупок. Без этого свести обороты к концу квартала удастся только вручную, а это риск ошибок и штрафов.
На общей системе базовые ставки таковы:
Поэтому в бизнес-плане считайте две величины: конечную нагрузку и сумму потенциального вычета. Если филиал закупает сырьё со ставкой 20 %, а продаёт готовую продукцию с 10 %, компания получит излишек налогового вычета и возврат денег.

Сегодня упрощённая система считается «безНДСной», но в реальности предприниматели платят налог при ввозе товаров или добровольно, если используют режим «УСН доходы минус расходы» и превысили лимит ставки. Фраза «НДС на УСН приняли» появилась после очередной реформы: закон разрешил упрощенцам становиться плательщиками НДС по заявлению, сохраняя при этом льготный расчёт единого налога.
Логика проста: компании хочется вычесть входной налог, чтобы не закладывать его в цену. В 2026 году уже обсуждают пилотный проект с гибкими ставками: 5 % НДС на УСН для IT-компаний и 10 % для сфер, связанных с импортом. Какой НДС на УСН в 2026 окажется итоговым, зависит от итогового текста законопроекта, но практика показывает, что контролёры оставят за ФНС право требовать ежеквартальную отчётность даже с минимальной ставкой.
Главный тревожный вопрос предпринимателей: «Какой процент НДС на УСН станут применять к 2025 году?» Пока обсуждают следующие коридоры:
| Объём выручки за год | Планируемая ставка | Доп. условие |
|---|---|---|
| До 120 млн руб. | на УСН без НДС | Сохраняем текущий режим |
| 120–200 млн руб. | УСН на НДС 10 % | Отдельная декларация не нужна |
| 200–300 млн руб. | НДС 20 % на УСН | Отчётность общая |
Переход на НДС при УСН не отменяет лимита расходов. Выручка на УСН для НДС считается по кассовому методу, а для единого налога — по дате отгрузки, поэтому бухгалтер вычисляет разницу, чтобы избежать двойного налогообложения.
Да, если головной офис укладывается в лимиты и ведёт раздельный учёт. Однако «переход на ОСНО при открытии филиала» часто затягивает за собой весь бизнес: поставщики начинают выставлять счета на головную организацию, инспекция требует объединённые отчёты, и документально соблюсти разграничение становится дорого.
Ситуация «ИП на УСН в 2026 году НДС» выглядит парадоксально, но встречается в дистрибуции. Индивидуальный предприниматель сохраняет упрощённый расчёт налога с доходов и одновременно выставляет счёт-фактуру клиенту, чтобы не потерять контракт. Полученный входной налог идёт в вычет, а базу по единому налогу он снижает на расходы — получается двойная экономия.
Слухи о «5 НДС на УСН» идут из проекта Минфина для малых экспортеров. Предлагается льготный тариф для компаний, которые живут на упрощёнке, но хотят получать нулевую ставку при экспорте и при этом вычитать входной налог. До утверждения закона рассчитывать на пятёрку рано, но готовить софт и учётные политики стоит уже сейчас.
Четыре года назад я консультировал перевозчика, который открыл филиал в Новосибирске. Выручка росла, добавилась «дорожная карта» с госзаказом. Головной офис на УСН «доходы минус расходы» платил 15 %, филиал претендовал на контракты с обязательным НДС. Мы приняли решение переходить на общую систему с 1 января:
Уже в первом квартале фирма получила к возмещению 1,8 млн рублей НДС благодаря крупной закупке тягачей. Расходы на бухгалтерию выросли на 350 тыс. рублей в год, но общая налоговая нагрузка снизилась.
Смена режима повышает интерес инспекции. Забыли подписать счёт-фактуру, не сверили книги продаж — камералка обернётся доначислением. Обязательно проведите внутренний аудит перед сдачей первой декларации.

Если бухгалтер вовремя не выделит расходы филиала, вся организация может превысить лимит и автоматически перейти на общую систему со следующего года. Фиксируйте операции филиала отдельными субсчетами и контролируйте агрегированные показатели каждый месяц.
Филиал способен ускорить развитие компании, но тянет за собой серьёзные налоговые перемены. Чем раньше предприниматель примет их как часть стратегии, тем спокойнее пройдёт адаптация. Тщательная подготовка к общей системе, корректный расчёт НДС и дисциплинированный раздельный учёт позволяют не только избежать штрафов, но и извлечь выгоду из нового статуса. Ведь главная цель бизнеса — расти, а грамотно выбранный налоговый режим лишь инструмент, который помогает сделать этот рост устойчивым.
При заключении договора на комплексное бухгалтерское обслуживание ответственность за качество отчетности и возможные претензии со стороны контролирующих органов ложится на нашу компанию.
Страхование профессиональной ответственности в АО «АльфаСтрахование» на 1 млн. руб.